科学研究

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陈宇综

科研不进则退
治学需求真重德

陈宇综

Yuzong Chen

医药健康技术与工程研究所

资深研究员

chenyuzong@sz.tsinghua.edu.cn

Timeline

  • 2021 至今

    深圳湾实验室         资深研究员

  • 2013 至今

    清华大学深圳国际研究生院         教授

  • 2007-2021

    新加坡国立大学药学系         教授

  • 2004-2005

    新加坡国立大学计算科学系         主任

  • 1997-2005

    新加坡国立大学计算科学系         助理教授,副教授

  • 1997

    美国ISIS制药公司         科学家

  • 1996-1997

    美国Toledo大学物理系         访问助理教授

  • 1989-1996

    美国普渡大学         博士后

  • 1985-1989

    英国曼彻斯特大学数学系 理论物理专业         博士

  • 1982-1985

    中科院理论物理所         硕士

  • 1978-1982

    大连理工大学应用物理系         学士









研究方向


1. 人工智能在生物医药领域的应用

2. 生物信息学

3. 计算机辅助药物设计

4. 科学与艺术(蛋白质美术,音乐)






成果


主要学术成就:

• 发明了反向对接靶点发现方法

 创建了国际医药领域知名的TTD药靶数据库

 创建了全球首个科研类中药数据库,天然产物定量活性数据库,功能植物综合活性数据库

 开创性的应用系统生物学原理分析西药及草药的协同作用机理

 首次揭示了产药物种在生物进化空间的扎堆规律

 创新性的应用AI+生物信息学方法和中西药对比方法阐明中药治疗新冠肺炎的机理

 国际上首批学者将AI引进生物和药物研究

 发展了AI开箱即用深度学习药物筛选新方法

 国际上首批创作蛋白质音乐和蛋白质美术作品

 应用AI创作蛋白质美术作品

 

代表性研究成果和学术奖励:

H指数 50 (SCI),  52 (Scopus), 53 (Research Gate), 63 (Google Scholar) ,总引  9141 (SCI), 9967 (Scopus), 10,157 (Research Gate), 15,681 (Google Scholar)。

以通讯作者在Nature Biotechnology(影响因子35), Nature Review Drug Discovery(影响因子50), Nature Machine Inteligence, Pharmacological Review(影响因子18), Trends in Pharmacological Sciences (影响因子12), PNAS(影响因子9), Cancer Research(影响因子9), Natural Product Reports (影响因子11),  Nucleic Acids Research(影响因子11)等杂志发表240多篇文章。






代表性图片


MolMap特征生成流程图:

图片1.png





荣誉奖励


2007,新加坡国立大学杰出科学家奖






媒体报道


清华博士生深度学习模型MolMapNet登上Nature子刊,可预测药物特性

 





招聘信息


1. 副研究员/助理研究员

2. 博士后

3. 研究助理




代表论文


(1) Shen, Wanxiang;  Zeng, Xian;  Zhu, Feng;  Wang, Yali;  Qin, Chu;  Tan, Ying;  Jiang, Yuyang*; Chen, Yuzong*, Out-of-the-box deep learning prediction of pharmaceutical properties by broadly learned knowledge-based molecular representations. Nat. Mach. Intell., 2021, 3 (4), 334-343.

(2) Li, Yinghong;  Li, Xiaoxu;  Hong, Jiajun;  Wang, Yunxia;  Fu, Jianbo;  Yang, Hong;  Yu, Chunyan;  Li, Fengcheng;  Hu, Jie;  Xue, Weiwei;  Jiang, Yuyang;  Chen, Yuzong*; Zhu, Feng*, Clinical trials, progression-speed differentiating features and swiftness rule of the innovative targets of first-in-class drugs. Briefings in Bioinformatics, 2020, 21 (2), 649-662.

(3) Zeng, Xian;  Zhang, Peng;  Wang, Yali;  Qin, Chu;  Chen, Shangying;  He, Weidong;  Tao, Lin;  Tan, Ying;  Gao, Dan;  Wang, Bohua;  Chen, Zhe;  Chen, Weiping*;  Jiang, Yuyang*; Chen, Yuzong*, CMAUP: a database of collective molecular activities of useful plants. Nucleic Acids Research, 2019, 47 (D1), D1118-D1127.

(4) Feng Zhu, Xiaoxu Li, Shengyong Yang, Yuzong Chen*. Clinical Success of Drug Targets Prospectively Predicted by In Silico Study. Trends Pharmacol Sci 39(3):229-231. (2018)

(5) Zeng, Xian;  Zhang, Peng;  He, Weidong;  Qin, Chu;  Chen, Shangying;  Tao, Lin;  Wang, Yali;  Tan, Ying;  Gao, Dan;  Wang, Bohua;  Chen, Zhe;  Chen, Weiping*;  Jiang, Yuyang*; Chen, Yuzong*, NPASS: natural product activity and species source database for natural product research, discovery and tool development. Nucleic Acids Research, 2018, 46 (D1), D1217-D1222.