科研动态

科研动态|周耀旗课题组及合作者最新成果:开发预测RNA主链二面角的方法

2021-05-31

科研动态|周耀旗课题组及合作者最新成果:开发预测RNA主链二面角的方法

许多疾病(包括癌症)跟非编码RNA相关,但是我们对它们的了解甚少,因为用于理解它们功能机制的结构很难被X射线晶体衍射、核磁共振和冷冻电镜等物理方法所解析。没有机制的理解,就没有彻底解决疾病的手段,所以通过计算来预测RNA结构,大幅度提高其精度势在必行。长期以来,RNA结构的预测集中在二级结构(碱基配对),并把它用于三级结构预测的约束,但对决定整体结构的RNA主链二面角却束手无策,只能依赖于并不十分可靠的能量函数来优化,周耀旗与格里菲斯大学的Paliwal课题组合作开发的、利用深度学习来预测主链二面角的工具将改变这个状态,这个开创性成果发表在 J. Chem. Info. Modeling (2021)上。

科研动态 | BRiQ-RNA:周耀旗课题组成功实现对RNA近天然态结构的高精度优化修正

2021-05-18

科研动态 | BRiQ-RNA:周耀旗课题组成功实现对RNA近天然态结构的高精度优化修正

蛋白质和RNA结构的实验解析远远满足不了需求,计算预测成为必须。蛋白质结构预测难,RNA结构预测更难,而对预测的结构模型进行的高精度修正更是难上加难。深圳湾实验室熊鹏博士为第一作者,格里菲斯大学詹剑博士和深圳湾实验室周耀旗研究员为通讯作者,与中山大学的巫瑞波教授合作一起发展的BRiQ-RNA方法可以对接近天然态结构的初始RNA结构模型有效改进,从而向最终实现高精度RNA结构预测的目标迈进了一步。实现高精度RNA结构预测必将为非编码RNA功能的发现及解释,RNA药物的设计与开发带来深远的影响。这一成果发表在Nature Communications 12, Article number: 2777 (2021)。

科研动态|黄湧/陈杰安课题组开发全新的双官能团化氮杂环卡宾的非共价不对称活化策略

2021-05-17

科研动态|黄湧/陈杰安课题组开发全新的双官能团化氮杂环卡宾的非共价不对称活化策略

近日,黄湧/陈杰安课题组在《ACS Catalysis》期刊上发表了文章A Bifunctional N‑Heterocyclic Carbene as a Noncovalent Organocatalyst for Enantioselective Aza-Michael Addition Reaction,借鉴金鸡纳碱催化剂家族的双官能团化进化途径,在常规三氮唑氮杂环卡宾的骨架基础之上,额外引入(硫)脲模块作为氢键供体(H-bonding donor, HBD),设计了双功能(硫)脲-氮杂环卡宾催化剂前体(NHC-HBD),并成功应用于非共价不对称催化模型中,实现二级胺的不对称aza-Michael反应,高效合成α-手性三级胺类化合物。

科研动态|深圳湾实验室杨竞课题组揭示肠神经系统退行性病变的全新免疫调控作用

2021-05-13

科研动态|深圳湾实验室杨竞课题组揭示肠神经系统退行性病变的全新免疫调控作用

近日,杨竞课题组在Protein & Cell期刊上发表了文章Sarm1-mediated neurodegeneration within the enteric nervous system protects against local inflammation of the colon,揭示了急性炎症条件下肠道内儿茶酚胺 (catecholaminergic)神经退行性病变的现象,并阐释这一神经病理现象受控于SARM1信号通路且出乎意料的发挥对抗疾病的保护性功能。

科研动态|深圳湾实验室肿瘤所张泽民/张雷Annu. Rev. Immunol.综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新特性

2021-04-29

科研动态|深圳湾实验室肿瘤所张泽民/张雷Annu. Rev. Immunol.综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新特性

近日,深圳湾实验室肿瘤研究所召集人、北京大学张泽民教授,北京大学副研究员任仙文及深圳湾实验室肿瘤研究所特聘研究员张雷在免疫学国际权威综述期刊《免疫学年度评论》(Annual Review of Immunology)上发表了题为Insights Gained from Single-Cell Analysis of Immune Cells in the Tumor Microenvironment的综述文章,系统地总结了单细胞转录组技术在解析肿瘤微环境,包括浸润T细胞和髓系免疫细胞新特性的最新研究进展,以及其在揭示肿瘤免疫治疗机制上的应用和潜力,并对这一领域当前尚未解决的问题进行了展望。

科研动态 | 深圳湾实验室饶浪课题组及合作者:应对COVID-19细胞因子风暴的潜在策略

2021-04-27

科研动态 | 深圳湾实验室饶浪课题组及合作者:应对COVID-19细胞因子风暴的潜在策略

近期,深圳湾实验室医药健康技术与工程研究所饶浪课题组和新加坡国立大学陈小元、王炯伟教授团队合作,总结了新型生物材料在炎性疾病治疗领域的进展,特别聚焦在新冠肺炎COVID-19细胞因子风暴。研究阐述了COVID-19细胞因子风暴的潜在机制与治疗策略;概述了旨在改善重症COVID-19患者异常炎症反应的进行中的临床试验;并强调了新型生物材料在改善基于抗体和广谱细胞因子中和作用方面的作用。

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